- Любовные романы
- Фантастика и фэнтези
- Ненаучная фантастика
- Ироническое фэнтези
- Научная Фантастика
- Фэнтези
- Ужасы и Мистика
- Боевая фантастика
- Альтернативная история
- Космическая фантастика
- Попаданцы
- Юмористическая фантастика
- Героическая фантастика
- Детективная фантастика
- Социально-психологическая
- Боевое фэнтези
- Русское фэнтези
- Киберпанк
- Романтическая фантастика
- Городская фантастика
- Технофэнтези
- Мистика
- Разная фантастика
- Иностранное фэнтези
- Историческое фэнтези
- LitRPG
- Эпическая фантастика
- Зарубежная фантастика
- Городское фентези
- Космоопера
- Разное фэнтези
- Книги магов
- Любовное фэнтези
- Постапокалипсис
- Бизнес
- Историческая фантастика
- Социально-философская фантастика
- Сказочная фантастика
- Стимпанк
- Романтическое фэнтези
- Ироническая фантастика
- Детективы и Триллеры
- Проза
- Юмор
- Феерия
- Новелла
- Русская классическая проза
- Современная проза
- Повести
- Контркультура
- Русская современная проза
- Историческая проза
- Проза
- Классическая проза
- Советская классическая проза
- О войне
- Зарубежная современная проза
- Рассказы
- Зарубежная классика
- Очерки
- Антисоветская литература
- Магический реализм
- Разное
- Сентиментальная проза
- Афоризмы
- Эссе
- Эпистолярная проза
- Семейный роман/Семейная сага
- Поэзия, Драматургия
- Приключения
- Детская литература
- Загадки
- Книга-игра
- Детская проза
- Детские приключения
- Сказка
- Прочая детская литература
- Детская фантастика
- Детские стихи
- Детская образовательная литература
- Детские остросюжетные
- Учебная литература
- Зарубежные детские книги
- Детский фольклор
- Буквари
- Книги для подростков
- Школьные учебники
- Внеклассное чтение
- Книги для дошкольников
- Детская познавательная и развивающая литература
- Детские детективы
- Домоводство, Дом и семья
- Юмор
- Документальные книги
- Бизнес
- Работа с клиентами
- Тайм-менеджмент
- Кадровый менеджмент
- Экономика
- Менеджмент и кадры
- Управление, подбор персонала
- О бизнесе популярно
- Интернет-бизнес
- Личные финансы
- Делопроизводство, офис
- Маркетинг, PR, реклама
- Поиск работы
- Бизнес
- Банковское дело
- Малый бизнес
- Ценные бумаги и инвестиции
- Краткое содержание
- Бухучет и аудит
- Ораторское искусство / риторика
- Корпоративная культура, бизнес
- Финансы
- Государственное и муниципальное управление
- Менеджмент
- Зарубежная деловая литература
- Продажи
- Переговоры
- Личная эффективность
- Торговля
- Научные и научно-популярные книги
- Биофизика
- География
- Экология
- Биохимия
- Рефераты
- Культурология
- Техническая литература
- История
- Психология
- Медицина
- Прочая научная литература
- Юриспруденция
- Биология
- Политика
- Литературоведение
- Религиоведение
- Научпоп
- Психология, личное
- Математика
- Психотерапия
- Социология
- Воспитание детей, педагогика
- Языкознание
- Беременность, ожидание детей
- Транспорт, военная техника
- Детская психология
- Науки: разное
- Педагогика
- Зарубежная психология
- Иностранные языки
- Филология
- Радиотехника
- Деловая литература
- Физика
- Альтернативная медицина
- Химия
- Государство и право
- Обществознание
- Образовательная литература
- Учебники
- Зоология
- Архитектура
- Науки о космосе
- Ботаника
- Астрология
- Ветеринария
- История Европы
- География
- Зарубежная публицистика
- О животных
- Шпаргалки
- Разная литература
- Зарубежная литература о культуре и искусстве
- Пословицы, поговорки
- Боевые искусства
- Прочее
- Периодические издания
- Фанфик
- Военное
- Цитаты из афоризмов
- Гиды, путеводители
- Литература 19 века
- Зарубежная образовательная литература
- Военная история
- Кино
- Современная литература
- Военная техника, оружие
- Культура и искусство
- Музыка, музыканты
- Газеты и журналы
- Современная зарубежная литература
- Визуальные искусства
- Отраслевые издания
- Шахматы
- Недвижимость
- Великолепные истории
- Музыка, танцы
- Авто и ПДД
- Изобразительное искусство, фотография
- Истории из жизни
- Готические новеллы
- Начинающие авторы
- Спецслужбы
- Подростковая литература
- Зарубежная прикладная литература
- Религия и духовность
- Старинная литература
- Справочная литература
- Компьютеры и Интернет
- Блог
Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома - Несса Кэри
Шрифт:
Интервал:
Закладка:
3. Эти стадии очень четко описаны в ряде обзоров. Напр.: WangGS, Cooper ТА. Splicing in disease: disruption of the splicing code and the decoding machinery. Nat Rev Genet. 2007 Oct; 8(10):749-61.
4. Подробнее о сплайсосоме см., напр., в: Padgett RA. New connections between splicing and human disease. Trends Genet. 2012 Apr; 28(4):147-54.
5. http://ghr.nlm.nih.gov/condition/retinitis-pigmentosa.
6. Vithana EN, Abu-Safeh L, Allen MJ, Carey A, Papaioannou M, Chakarova C, Al-Maghtheh M, Ebenezer ND, Willis C, Moore AT, Bird AC, Hunt DM, Bhattacharya SS. A human homolog of yeast pre-mRNA splicing gene, PRP31, underlies autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 19ql3.4(RPll). Mol Cell. 2001 Aug; 8<2):375-81.
7. McKie AB, McHale JC, Keen TJ, Tarttelin EE, Goliath R, van Lith-Verhoeven JJ, Greenberg J, Ramesar RS, Hoyng CB, Cremers FP, Mackey DA, Bhattacharya SS, Bird AC, Markham AF, Inglehearn CF. Mutations in the pre-mRNA splicing factor gene PRPC8 in autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP13). Hum Mol Genet. 2001 Jul 15;10(15): 1555-62.
8. Chakarova CF, Hirns MM, Bolz H, Abu-Safeh L, Patel RJ, Papaioannou MG, Inglehearn CF, Keen TJ, WillisC, Moore AT, RosenbergT, Webster AR, Bird AC, Gal A, Hunt D, Vithana EN, Bhattacharya SS. Mutations in HPRP3, a third member of pre-mRNA splicing factor genes, implicated in autosomal dominant retinitis pigmentosa. Hum Mol Genet. 2002 Jan 1;11(1):87-92.
9. Maita H, Kitaura H, Keen TJ, Inglehearn CF, Ariga H, Iguchi-Ariga SM. PAP-1, the mutated gene underlying the RP9 form of dominant retinitis pigmentosa, is a splicing factor. Exp Cell Res. 2004 Nov 1;300(2):283-96.
10. Микроцефальная остеодиспластическая примордиальная карликовость первого типа (также называется синдромом Тауби-Линдера): http://rarediseases.info.nih.gov/gard/5120/microcephalic-osteodysplastic-primordial-dwarfism-type-1 /resources/1.
11. Не H, Liyanarachchi S, Akagi K, Nagy R, Li J, Dietrich RC, U W, Sebastian N, Wen B, Xin B, Singh J, Yan P, Aider H, Haan E, Wieczorek D, Albrecht B, Puf fenberger E, Wang H, Westman JA, Padgett RA, Symer DE, de la Chapelle A. Mutations in U4atac snRNA, a component of the minor spliceosome, in the developmental disorder MOPD I. Science. 2011 Apr 8;332(6026):238-40.
12. Padgett RA. New connections between splicing and human disease. Trends Genet. 2012 Apr; 28(4):147-54.
13. Haas JT, Winter HS, Lim E, Kirby A, Blumenstiel B, DeFelice M, Gabriel S, Jalas C, Branski D, Grueter CA, Toporovski MS, Walther TC, Daly MJ, Farese RV Jr. DGAT1 mutation is linked to a congenital diarrheal disorder. J. Clin. Invest. 2012 Dec 3; 122(12):4680-4.
14. Byun M, Abhyankar A, Leiarge V, Plancoulaine S, Palanduz A, Telhan L, Boisson В, Picard C, Dewell S, Zhao C, Jouanguy E, Feske S, Abel L, Casanova JL. Whole-exome sequencing-based discovery of STIM1 deficiency in a child with fatal classic Kaposi sarcoma. J.Exp. Med. 2010 Oct 25;207(11):2307-12.
15. См.: http://www.genome.gov/11007255.
16. Eriksson M, Brown WT, Gordon LB, Glynn MW, Singer J, Scott L, Erdos MR, Robbins CM, Moses TY, Berglund P, Dutra A, Pak E, Durkin S, Csoka AB, Boehnke M, Glover TW, Collins FS. Recurrent de novo point mutations in lamin A cause Hutchinson-Gilford progeria syndrome. Nature. 2003 May 15;423(6937):293-8.
17. http://www.nhs.uk/conditions/spinal-muscular-atrophy/Pages/ Introduction.aspx.
18. http://www.smatnist.org/what-is-sma/what-causes-sma.
19. Monani UR, Lorson CL, Parsons DW, Prior TW, Androphy EJ, Burghes AH, McPherson JD. A single nucleotide difference that alters splicing patterns distinguishes the SMA gene SMN1 from the copy gene SMN2. Hum Mot Genet. 1999 Jul; 8(7):1177-83.
20. Cooper TA, Wan L, Dreyfuss G. RNA and disease. Cell. 2009 Feb 20; 136(4): 777-93.
21. http://quest.mda.org/news/dmd-drisapersen-outperforms-place-bo-walking-test.
22. http://www.fiercebiotech.com/story/glaxosmithklines-duc-henne-md-drug-mirrors-placebo-effect-phiii/2013-10-07.
Глава 181. Ameres SL, Zamore PD. Diversifying microRNA sequence and function. Nat Rev Mot Celt Biol. 2013 Aug; 14(8):475-88.
2. Более подробное описание классов малых РНК см. в: Castel SE, Martienssen RA. RNA interference in the nucleus: roles for small RNAs in transcription, epigenetics and beyond. Nat Rev Genet. 2013 Feb; 14(2): 100—12.
3. Kang SG, Liu WH, Lu P, Jin HY, Lim HW, Shepherd J, Fremgen D, Verdin E, Oldstone MB, Qi H, Teijaro JR, Xiao C. MicroRNAs of the miR-17-92 family are critical regulators of T (FH) differentiation. Nat Immunol. 2013 Aug; 14 (8):849-57.
4. Baumjohann D, Kageyama R, Clingan JM, Morar MM, Patel S, de Kouchkovsky D, Bannard 0, Bluestone JA, Matloubian M, Ansel KM, Jeker LT. The microRNA cluster miR-17-92 promotes TFH cell differentiation and represses subset-inappropriate gene. Nat Immunol. 2013 Aug; 14(8):840-8.
5. Tassano E, Di Rocco M, Signa S, Gimelli G. De novo 13q31.1-q32.1 interstitial deletion encompassing the miR-17-92 cluster in a patient with Feingold syndrome-2. Am J Med Genet A. 2013 Apr; 161A(4):894-6.
6. Подробнее см. в: http://ghr.nlm.nih.gov/condition/feingold-syndrome.
7. Han YC, Ventura A. Control of T (FH) differentiation by a microRNA cluster. Nat Immunol. 2013 Aug; 14(8):770-1.
8. Цит. no: Koerner MV, Pauler FM, Huang R, Barlow DP. The function of non-coding RNAs in genomic imprinting. Development. 2009 Jun; 136(11):1771-83.
9. Rogler LE, Kosmyna B, Moskowitz D, Bebawee R, Rahimzadeh J, Kutchko K, Laederach A, Notarangelo LD, Giliani S, Bouhassira E, Frenette P, Roy-Chowdhury J, Rogler CE. Small RNAs derived from In cRNA RNase MRP have gene-silencing activity relevant to human cartilage-hair hypoplasia. Hum Mol Genet. 2014 Jan 15;23(2):368-82.
10. Subramanyam D, Lamouille S, Judson RL, Liu JY, Bucay N, Derynck R, Blelloch R. Multiple targets of miR-302 and miR-372 promote reprogramming of human fibroblasts to induced pluripotent stem cells. Nat Biotechnol. 2011 May; 29(5):443-8.
11. Li Z, Yang CS, Nakashima K, Rana TM. Small RNA-mediated regulation of iPS cell generation. EMBO J. 2011 Mar 2;30(5):823-34.
12. Ameres SL, Zamore PI). Diversifying microRNA sequence and function. Nat Rev Mot Cell Biol. 2013 Aug; 14(8):475-88.
13. Huang TC, Sahasrabuddhe NA, Kim MS, Getnet D, Yang Y, Peterson JM, Ghosh B, Chaerkady R, Leach SD, Marchionni L, Wong GW, Pandey A. Regulation of lipid metabolism by Dicer revealed through SILAC mice. J Proteome Res. 2012 Apr 6;11(4):2193-205.
14. Yi R, O’Carroll D, Pasolli HA, ZhangZ, Dietrich FS, TarakhovskyA, Fuclis E. Morphogenesis in skin is governed by discrete sets of differentially expressed microRNAs. Nat Genet. 2006 Mar; 38(3):356-62.
15. Crist CG, Montarras D, Pallafacchina G, Rocancourt D, Cumano A, Conway SJ, Buckingham M. Muscle stem cell behavior is modified by microRNA-27 regulation of Pax3 expression. Proc Natl Acad Sci USA. 2009 Aug 11;106(32): 13383—7.
16. Chen JF,Tao Y,Li J, DengZ, YanZ, Xiao X, Wang DZ. MicroRNA-1 and microRNA-206 regulate skeletal muscle satellite cell proliferation and differentiation by repressing Pax7. J. Cell Biol. 2010 Sep 6;190(5):867 79.
17. da Costa Martins PA, Bourajjaj M, Gladka M, Kortland M, van Oort RJ, Pinto YM, Molkentin JD, De Windt LJ. Conditional dicer gene deletion in the postnatal myocardium provokes spontaneous cardiac remodeling. Circulation. 2008 Oct 7; 118(15):1567-76.
18. de Chevigny A, Core N, Follert P, Gaudin M, Barbry P, Béclin C, Cremer H. miR-7a regulation of Pax6 controls spatial origin of forebrain dopaminergic neurons. Nat Neurosci. 2012 Jun 24;15(8):1120-6.
19. Konopka W, Kiryk A, Novak M, Herwerth M, Parkitna JR, Wawrzyniak M, Kowarsch A, Michaluk P, Dzwonek J, Arnsperger T, Wilczynski G, Merkenschlager M, Theis FJ, Köhr G, Kaczmarek L, Schütz G. MicroRNA loss enhances learning and memory in mice. J Neurosci. 2010 Nov 3;30 (44):14835-42.
20. Schaefer A, O’Carroll D, Tan CL, Hillman D, Sugimori M, Llinas R, Greengard P. Cerebellar neurodegeneration in the absence of microRNAs. J Exp Med. 2007 Jul 9;204(7): 1553-8.
21. Pietrzykowski AZ, Friesen RM, Martin GE, Puig SI, Nowak CL, Wynne PM, Siegelmann HT, Treistman SN. Posttranscriptional regulation of BK channel splice variant stability by miR-9 underlies neuroadaptation to alcohol. Neuron. 2008 Jul 31;59(2):274-87.
22. Hollander JA, Ini HI, Amelio AL, Kocerha J, Bali P, Lu Q, Willoughby D, Wahlestedt C, Conkright MD, Kenny PJ. Striatal microRNA controls cocaine intake through CREB signalling В]. Nature. 2010 Jul 8;466(7303): 197-202.
23. Fernandez-Hernando C, Baldàn A. MicroRNAs and Cardiovascular Disease. Curr. Genet. Med. Rep. 2013 Mar; 1(1):30-38.
24. Вот один из обзоров, посвященных данной теме: Suzuki Н, Maruyama R, Yamamoto Е, Kai М. Epigenetic alteration and microRNA dysregulation in cancer. Front Genet. 2013 Dec 3;4:258. eCollection 2013.
25. Kleinman CL, Gerges N, Papillon-Cavanagh S, Sin-Chan P, Pramatarova A, Quang DA, Adoue V, Busche S, Caron M, Djainbazian H, Bemmo A, Fontebasso AM, Spence T, Schwartzentruber J, Albrecht S, Hauser P, Garami M, Klekner A, Bognar L, Montes L, Staffa A, Montpetit A, Berube P, Zakrzewska M, Zakrzewski K, Liberski PP, Dong Z, Siegel PM, Duchaine T, Perotti C, Fleming A, Faury D, Remke M, Gallo M, Dirks P, Taylor MD, Sladek R, Pastinen T, Chan JA, Huang A, Majewski J, JabadoN. Fusion ofTTYHl with theC19MC microRNA cluster drives expression of a brain-specific DNMT3B isoform in the embryonal brain tumor ETMR. Nat Genet. 2014 Jan; 46 (1):39-44.
26. Song SJ, Poliseno L, Song MS, Ala U, Webster K, Ng C, Beringer G, Brikbak NJ, Yuan X, Cantley LC, Richardson AL, Pandolf PP. MicroRNA-antagonism regulates breast cancer sternness and metastasis via TET-family-dependent chromatin remodeling. Ceil. 2013 Jul 18;154(2):311-24.
27. Подробное изложение особенностей данного подхода см. в: Schwarzenbach H, Nishida N, Câlin GA, Pantel K. Clinical relevance of circulating cell-free microRNAs in cancer. Nat Rev Clin Oncol. 2014 Mar; 11(3): 145—56.
28. Chen W, Cai F, Zhang B, Barekati Z, Zhong XY. The level of circulating miRNA-lOb and miRNA-373 in detecting lymph node metastasis of breast cancer: potential biomarkers. Tumour Biol. 2013 Feb; 34(1):455-62.
29. Hong F, Li Y, Xu Y, Zhu L. Prognostic significance of serum mi-croRNA-221 expression in human epithelial ovarian cancer. J. Int. Med. Res. 2013 Feb; 41(1):64-71.
30. Shen J, Liu Z, Todd NW, Zhang H, Liao J, Yu L, Guarnera MA, Li R, Cai L. Zhan M, Jiang F. Diagnosis of lung cancer in individuals with solitary pulmonary nodules by plasma microRNA biomarkers. BMC Cancer. 2011 Aug 24;11:374.
31. Подробнее см. в: http://emedicine.medscape.com/article/233442-overview.
32. Trobaugh DW, Gardner CL, Sun C, Haddow AD, Wang E, Chapnik E, Mildner A, Weaver SC, Ryman KD, Klimstra WB. RNA viruses can hijack vertebrate microRNAs to suppress innate immunity. Nature. 2014 Feb 13;506(7487):245-8.
33. JoplingCL, Yi M, Lancaster AM, Lemon SM, Sarnow P. Modulation of hepatitis C virus RNA abundance by a liver-specific MicroRNA. Science. 2005 Sep 2:309(5740): 1577-81.
Глава 191. Краткий перечень лекарств, активнее всего продававшихся за последние годы, см. в: http://www.fiercepharma.com/special-reports/ 15-best-selling-drugs-2012.
2. Этой сфере посвящено множество блогов. Напр.: http://biop-harmconsortium.com/rnai-therapeutics-stage-a-comeback.
3. Подробнее см. в: http://ghr.nlm.nih.gov/condition/transthyre-tin-amyloidosis.
4. http://investors.alnylam.com/releasedetail.cfm?ReleaseID-805999.
5. Все новости о данной программе можно найти здесь: http://mir-narx.com/pipeline/mirna-MRX34.html.
6. Koval ED, Shaner C, Zhang P, du Maine X, Fischer K, Tay J, Chau BN, Wu GF, Miller TM. Method for widespread microRNA-155 inhibition prolongs survival in ALS-model mice. Hum Mol Genet. 2013 Oct 15; 22(20):4127-35.
7. Ozsolak F, Kapranov P, Foissac S, Kim SW, Fishilevich E, Monaghan AP, John B, Milos PM. Comprehensive polyadenylation site maps in yeast and human reveal pervasive alternative polyadenylation. Celt. 2010 Dec 10; 143(6): 1018-29.
8. Очень хороший обзор, посвященный тому, как антисмысловая экспрессия может регулировать гены: Pelechano V, Stein me tz LM. Gene regulation by antisense transcription. Nat Rev Genet. 2013 Dec; 14(12):880-93.
9. http://www.dmgs.com/cons/fomivirsen-intraocular.html.
10. https://www.bhf.org.uk/heart-matters-online/august-septem-ber-2012/medical/familial-hypercholesterolaemia.aspx.
11. http://www.medscape.com/viewarticle/804574_5.

